冷冻干燥机器是一种常用于生物制品、药物、食品等领域的设备，它可以将液态样品在低温下进行冷冻处理，再通过抽取水分的方式将样品中的水分转化为冰晶，最后将冰晶在低压下升华成为干燥的固体，从而将样品长期保存下来。然而，在使用冷冻干燥机器的过程中，有时会出现样品化成水的问题，这种情况一般是由以下原因引起的。

第一，样品的初冻过程不充分。在冷冻干燥机器中，样品的初冻过程非常重要，如果样品的初冻过程不充分，会导致样品中的水分没有完全冻结成冰晶，而是形成了大量的冰晶晶核，这些晶核会在真空下升华，从而使样品化成水。因此，在使用冷冻干燥机器的过程中，必须确保样品的初冻过程充分。

第二，真空度不够高。在冷冻干燥机器中，真空度是影响干燥效果的重要因素之一，如果真空度不够高，会导致样品中的水分没有完全升华，从而使样品化成水。因此，在使用冷冻干燥机器的过程中，必须保证真空度足够高。

第三，加热速度过快。在冷冻干燥机器中，加热速度是影响干燥效果的另一个重要因素，如果加热速度过快，会导致样品中的水分没有完全升华，从而使样品化成水。因此，在使用冷冻干燥机器的过程中，必须控制加热速度，保证样品中的水分充分升华。

第四，操作不规范。在使用冷冻干燥机器的过程中，如果操作不规范，也会导致样品化成水。例如，未正确设置真空度、加热温度和时间等参数，或者未及时清理冷凝器等部件，都可能导致样品化成水。因此，在使用冷冻干燥机器的过程中，必须严格按照使用说明书进行操作，确保操作规范。

针对以上问题，可以采取以下对策：

第一，加强样品的初冻过程。在样品初冻过程中，可以采用逐渐降温的方式，使样品中的水分逐渐凝固成冰晶，从而避免形成大量的冰晶晶核。此外，还可以采用低温冷冻的方式，使样品中的水分更加充分地冻结成冰晶。

第二，保证真空度足够高。在使用冷冻干燥机器的过程中，必须保证真空泵的性能良好，并定期进行维护和保养，以确保真空度足够高。

第三，控制加热速度。在样品加热过程中，可以采用逐渐升温的方式，使样品中的水分逐渐升华，从而避免加热速度过快导致样品化成水。

第四，严格按照使用说明书进行操作。在使用冷冻干燥机器的过程中，必须严格按照使用说明书进行操作，设置真空度、加热温度和时间等参数，并及时清理冷凝器等部件，以确保操作规范。

综上所述，针对冷冻干燥机器中样品化成水的问题，我们可以采取以上对策，从而保证样品干燥的效果和质量。在使用冷冻干燥机器的过程中，还应注意安全操作，避免发生意外事故。